Program monitoringa mora biti zasnovan tako, da:
1.je spremljanje in nadzorovanje ob upoštevanju ocene tveganja podrobno določeno za vsak posamezen primer posebej;
2.so upoštevane značilnosti GSO, značilnosti in obseg njegove nameravane uporabe ter vsi pomembni pogoji v okolju, v katerem se sproščanje GSO pričakuje;
3.vključuje splošen nadzor nepričakovanih škodljivih učinkov, po potrebi pa tudi poseben monitoring škodljivih učinkov, ugotovljenih v oceni tveganja, pri čemer se upošteva:
- da je treba monitoring posameznega primera izvajati v takšnem časovnem obdobju, da je možno odkriti takojšnje in neposredne, pa tudi kasnejše ali posredne učinke, ugotovljene v oceni tveganja, in
- da se za spremljanje in nadziranje lahko uporabijo že obstoječi rutinski postopki, kot so monitoring kmetijskih kultivarjev, varstva rastlin ali veterinarskih in medicinskih proizvodov; če se za monitoring uporabijo ti postopki, je treba pojasniti, na kakšen način bodo tako zbrani podatki dostopni imetniku dovoljenja za dajanje izdelka, ki vsebuje GSO, na trg;
4.na sistematičen način olajša opazovanje sproščanja GSO v prejemnem okolju in njegovo interpretacijo glede varnosti za zdravje ljudi ali okolje;
5.določi:
- kdo (prijavitelj, uporabnik ali kdo drug) bo izvajal posamezne naloge iz programa monitoringa,
- kdo je odgovoren za pravilno vzpostavitev in izvajanje monitoringa v skladu s programom monitoringa in
- način obveščanja imetnika dovoljenja za dajanje izdelka, ki vsebuje GSO, na trg in ministrstva, pristojnega za varstvo okolja (v nadaljnjem besedilu: ministrstvo), o kakršnih koli opaženih škodljivih učinkih na zdravje ljudi in okolje, pri čemer je treba določiti tudi roke in časovne intervale za poročanje o rezultatih monitoringa;
6.pretehta in upošteva mehanizme za določanje in potrjevanje opaženih škodljivih učinkov na zdravje ljudi in okolje in omogoča imetniku dovoljenja za dajanje izdelka, ki vsebuje GSO, na trg ali ministrstvu, da izvede ukrepe za varstvo zdravja ljudi in okolja, če je to potrebno.